Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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