Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms