Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrriq1Q0P5X1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Lrriq1Q0P5X1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Lrriq1Q0P5X1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Lrriq1Q0P5X1 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Lrriq1Q0P5X1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Lrriq1Q0P5X1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms