Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms