Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tff1Q08423 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tff1Q08423 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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