Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AmbpQ07456 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms