Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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