Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms