Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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NfiaQ02780 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NfiaQ02780 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NfiaQ02780 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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NfiaQ02780 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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