Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms