Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms