Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EgfrQ01279 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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