Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms