Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms