Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb2P81069 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb2P81069 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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