Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ptprn2P80560 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ptprn2P80560 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ptprn2P80560 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptprn2P80560 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ptprn2P80560 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ptprn2P80560 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptprn2P80560 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptprn2P80560 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms