Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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