Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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