Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms