Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csrnp1P59054 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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