Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn18P56857 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn18P56857 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn18P56857 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn18P56857 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn18P56857 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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