Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PctpP53808 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PctpP53808 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PctpP53808 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PctpP53808 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms