Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms