Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TspoP50637 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms