Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl5P50228 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms