Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms