Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rfx1P48377 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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