Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms