Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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TtlP38585 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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TtlP38585 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TtlP38585 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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