Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms