Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Col8a2P25318 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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