Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfyaP23708 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms