Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms