Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim1P20664 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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