Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms