Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms