Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd5P13379 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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