Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nr4a1P12813 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms