Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms