Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P10404 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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