Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms