Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Eb1P04230 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms