Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P01788 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01788 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01788 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms