Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms