Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Psmb10O35955 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Psmb10O35955 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Psmb10O35955 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb10O35955 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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