Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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