Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Q1O19441 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms