Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms