Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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