Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm20939L7N243 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm20939L7N243 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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